Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab42Q0PD08 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms