Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps8Q0P5W1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms