Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnma1Q08460 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms