Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nfe2Q07279 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nfe2Q07279 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms