Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CkbQ04447 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms