Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx2Q03358 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms