Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nme2Q01768 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms