Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gabpb1Q00420 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabpb1Q00420 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms