Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1bP70700 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms