Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vamp3P63024 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vamp3P63024 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms