Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2fP61219 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms