Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ActbP60710 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ActbP60710 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ActbP60710 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms