Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P58686 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P58686 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P58686 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms