Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox7bP56393 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox7bP56393 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms