Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PitpnbP53811 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms