Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox5P52651 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox5P52651 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms