Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pa2g4P50580 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pa2g4P50580 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms