Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnni3P48787 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnni3P48787 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms