Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prox1P48437 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prox1P48437 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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