Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myo1bP46735 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myo1bP46735 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms