Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NodalP43021 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NodalP43021 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NodalP43021 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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