Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms