Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cd28P31041 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cd28P31041 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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