Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afxP27661 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afxP27661 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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