Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd247P24161 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd247P24161 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms