Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fcer1aP20489 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcer1aP20489 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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