Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou5f1P20263 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms