Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprqP0C5E4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms