Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc6O88978 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc6O88978 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms