Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrxO55103 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrxO55103 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrxO55103 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrxO55103 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrxO55103 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrxO55103 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrxO55103 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrxO55103 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrxO55103 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrxO55103 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms