Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms