Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E2f6O54917 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms