Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms