Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Sp100O35892 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sp100O35892 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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