Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx8O35652 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms