Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema6aO35464 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms