Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
U90926O08546 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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U90926O08546 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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U90926O08546 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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U90926O08546 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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