Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3239L7N2D9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm3239L7N2D9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3239L7N2D9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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