Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5225J3QPL3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5225J3QPL3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms