Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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