Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp17lcG5E8I7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms