Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atf6F6VAN0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Atf6F6VAN0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Atf6F6VAN0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Atf6F6VAN0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Atf6F6VAN0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atf6F6VAN0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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