Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms