Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC035044E0CXF8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
BC035044E0CXF8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms