Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim12cD3Z3L3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim12cD3Z3L3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms