Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rd3lB2RV38 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rd3lB2RV38 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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