Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms