Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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