Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms