Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vstm4T1NXB5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vstm4T1NXB5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vstm4T1NXB5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vstm4T1NXB5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vstm4T1NXB5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms